В середине 1898 г. Османская империя сделала последнюю попытку утвердить за собой остров. В июле в Кандию прибыл Джевад-паша, назначенный сначала генерал-губернатором, но вскоре смещенный на более скромный пост командующего турецких войск на Крите. Неоднократные столкновения Джевад-паши с Советом адмиралов европейских держав заставили османского султана в октябре 1898 г. отозвать его. В начале сентября 1898 г. в Кандии турецкие фанатики начали резню местных греков. Британский патруль, преградивший путь погромщикам и защищавший христиан, потерял одного офицера и тринадцать солдат убитыми и вдвое больше ранеными. Кроме того, был убит британский вице-консул и несколько сотен христиан. Беспорядки удалось прекратить лишь угрозой бомбардировки Кандии. После этого европейские державы предложили Османской империи вывести с Кипра свои войска. Была создана критская автономия под названием «Критское государство», которое находилось под управлением греческого принца Георга. В 1899 г. последние османские части покинули Крит. Вместе с ними уехала и значительная часть мусульман ост­рова. В 1900 г. принц Георг представил державам, контро­лировавшим Крит, меморандум об объединении острова с Грецией. Однако меморандум был отклонен правительства­ми великих держав. В ответ на Крите начались массовые выступления населения за воссоединение с Грецией. Пала­та депутатов Крита присягнула на верность королю Георгу I и постановила заменить поднятый повсю­ду критский флаг на греческий. Совет адмиралов потребовал спустить греческий флаг и попросил правительства своих стран выслать дополнитель­ные корабли к острову. В сентябре 1906 г. Совет адмиралов вынудил принца Георга оставить пост верховного комиссара. Его заменил Александрос Заимис — бывший премьер-министр Греции. Международные силы были выведены с Крита. Возникло движение «Энозис» за присоединение к Греции. Крит присоединился к Греции после второй Балканской войны, в конце 1913 года. По примерным оценкам, 90% населения острова тогда составляли греки.